Ich versuche herauszufinden, was bei der Verwendung von BLAST als guter Wert angesehen wird.
Ich verstehe, dass es sich um ein Werkzeug zur Sequenzausrichtung handelt, aber ich möchte wissen, was ein signifikantes oder zuverlässiges Ergebnis im Hinblick auf den Wert darstellt, den es generiert.
7 Antworten
Chloe_carter_model
Mon Oct 21 2024
Die Kriterien zur Bewertung der Qualität eines aus einer BLAST-Suche erhaltenen E-Werts sind entscheidend für die Bestimmung der Signifikanz eines Sequenzalignments.
EmilyJohnson
Mon Oct 21 2024
Im Bereich der Bioinformatik wird ein guter E-Wert-Schwellenwert als wesentlich angesehen, um unbedeutende Übereinstimmungen herauszufiltern und sich auf biologisch relevante Ergebnisse zu konzentrieren.
isabella_bailey_economist
Mon Oct 21 2024
Typischerweise wird ein Schwellenwert von e−5, der einer Chance von 1 zu 100.000 entspricht, durch Zufall eine Übereinstimmung zu erhalten, für viele Anwendungen als zufriedenstellend angesehen.
Bianca
Mon Oct 21 2024
Dieser Schwellenwert stellt sicher, dass nur Alignments mit einem hohen Grad an statistischer Signifikanz berücksichtigt werden, wodurch falsch positive Ergebnisse minimiert werden.
PulseWind
Sun Oct 20 2024
Die E-Wert-Berechnung berücksichtigt sowohl die Länge des Alignments als auch die Gesamthäufigkeit der übereinstimmenden Sequenzen in der durchsuchten Datenbank.