Estoy tratando de descubrir qué se consideraría un buen valor al usar BLAST.
Entiendo que es una herramienta para el alineamiento de secuencias, pero quiero saber qué constituye un resultado significativo o confiable en términos del valor que genera.
7 respuestas
Chloe_carter_model
Mon Oct 21 2024
Los criterios para evaluar la calidad de un valor E obtenido de una búsqueda BLAST son cruciales para determinar la importancia de una alineación de secuencia.
EmilyJohnson
Mon Oct 21 2024
En el ámbito de la bioinformática, un buen umbral de valor E se considera esencial para filtrar coincidencias insignificantes y centrarse en resultados biológicamente relevantes.
isabella_bailey_economist
Mon Oct 21 2024
Normalmente, un umbral de e-5, que se traduce en 1 entre 100.000 posibilidades de obtener una coincidencia por casualidad, se considera satisfactorio para muchas aplicaciones.
Bianca
Mon Oct 21 2024
Este umbral garantiza que solo se consideren las alineaciones con un alto grado de significación estadística, minimizando así los falsos positivos.
PulseWind
Sun Oct 20 2024
El cálculo del valor E tiene en cuenta tanto la longitud de la alineación como la frecuencia general de las secuencias coincidentes en la base de datos que se busca.