Estou tentando descobrir o que seria considerado um bom valor ao usar o BLAST.
Entendo que é uma ferramenta para alinhamento de sequências, mas quero saber o que constitui um resultado significativo ou confiável em termos do valor que gera.
7 respostas
Chloe_carter_model
Mon Oct 21 2024
Os critérios para avaliar a qualidade de um valor E obtido a partir de uma pesquisa BLAST são cruciais para determinar a significância de um alinhamento de sequência.
EmilyJohnson
Mon Oct 21 2024
No domínio da bioinformática, um bom limite de valor E é considerado essencial para filtrar correspondências insignificantes e focar em resultados biologicamente relevantes.
isabella_bailey_economist
Mon Oct 21 2024
Normalmente, um limite de e−5, que se traduz em 1 em 100.000 chances de obter uma correspondência por acaso, é considerado satisfatório para muitas aplicações.
Bianca
Mon Oct 21 2024
Este limite garante que apenas alinhamentos com alto grau de significância estatística sejam considerados, minimizando assim os falsos positivos.
PulseWind
Sun Oct 20 2024
O cálculo do valor E leva em consideração tanto o comprimento do alinhamento quanto a frequência geral das sequências correspondentes no banco de dados que está sendo pesquisado.