BLAST kullanırken neyin iyi bir değer olarak değerlendirilebileceğini bulmaya çalışıyorum.
Bunun dizi hizalama için bir araç olduğunu biliyorum, ancak ürettiği değer açısından neyin önemli veya güvenilir bir sonuç oluşturduğunu bilmek istiyorum.
7 cevap
Chloe_carter_model
Mon Oct 21 2024
Bir BLAST aramasından elde edilen bir E-değerinin kalitesini değerlendirmeye yönelik kriterler, bir dizi hizalamasının öneminin belirlenmesinde çok önemlidir.
EmilyJohnson
Mon Oct 21 2024
Biyoinformatik alanında, iyi bir E-değeri eşiğinin, önemsiz eşleşmeleri filtrelemek ve biyolojik açıdan anlamlı sonuçlara odaklanmak için gerekli olduğu düşünülmektedir.
isabella_bailey_economist
Mon Oct 21 2024
Tipik olarak, rastgele şansla bir eşleşme elde etme şansının 100.000'de 1'ine karşılık gelen e−5 eşiği, birçok uygulama için tatmin edici kabul edilir.
Bianca
Mon Oct 21 2024
Bu eşik, yalnızca yüksek düzeyde istatistiksel anlamlılığa sahip hizalamaların dikkate alınmasını sağlar ve böylece hatalı pozitifleri en aza indirir.
PulseWind
Sun Oct 20 2024
E-değeri hesaplaması, hem hizalamanın uzunluğunu hem de aranan veritabanındaki eşleşen dizilerin genel sıklığını hesaba katar.